抗菌肽(AMPs)是一种具有广谱抗菌作用的小分子活性肽,不仅耐酸碱、抗肿瘤、抗病毒,还不易产生耐药性,在医药、食品、农业、美妆等领域均有广泛的应用前景。
然而,由于其序列短、多样性高、相似性低的特点,抗菌肽的研究在很大程度上仍然需要借助反复的实验验证。因此,要开发新的抗菌肽或改进现有的抗菌肽,人工智能预测挖掘是有效手段。
但目前市面上针对抗菌肽的AI预测和挖掘模型较为有限,亟需高效便捷的AI工具实现突破。Tidetron Tao「本道」自动化研发平台覆盖合成生物DBTL循环各环节,态创生物在小分子功能肽领域积累了丰富研发经验和海量数据,为活性肽的AI预测奠定了坚实的基础。
态创生物研发团队整合优化ChatGPT、AlphaFold、Progen等先进技术和算法(Comparing and Optimizing Multiple DEep Learning),逐步形成了独特的算法逻辑层,快速搭建出活性肽AI预测和挖掘模型TIDETRON COMDEL。
就抗菌肽而言,除了现有数据库中的上万条抗菌肽外,TIDETRON COMDEL还收集了态创生物自主高通量筛选获得的2000多条抗菌肽数据,基本覆盖了市面上所有的抗菌肽种类。先进算法结合海量数据不断优化模型,这使得抗菌肽的设计和预测准确率达到行业前沿水平,实现了新的突破。
此外,TIDETRON COMDEL操作简便快捷,用户只需填写基本的序列信息,即可得到该序列为抗菌肽的概率,大大降低筛选的时间和人力成本。
通过抗菌肽的预测,TIDETRON COMDEL不仅可以辅助指导、筛选目标物质,更有助于实现其在终端应用的提质增效。
除了抗菌肽,免疫调节肽、细胞信号肽等等活性肽虽然功效不一,但底层预测逻辑具备一定的相似性。TIDETRON COMDEL已布局10+种活性肽预测模型的开发,探索AI for Synbio的无限可能。
目前TIDETRON COMDEL只是AI赋能合成生物的一小步,但其泛化迁移能力有望突破应用边界,未来在结构、活性、功能、靶点、应用、产量等方面的预测研究将迈出一大步。
其实不止蛋白质预测,态创生物打造的Tidetron Tao AI引擎对于整个合成生物选品、酶的设计与改造、代谢通路设计等都具备指导意义,可以有效节省人力、时间成本,驱动物质快速量产。
科技向善,共启未来。态创生物依托合成生物平台不断创新,并在行业内率先开放共享AI抗菌肽预测和挖掘模型,希望与各界伙伴一同构建AI赋能合成生物的良好生态,共创绿色可持续的“生物时代”。