合成生物学的目的是设计符合标准的生物系统,但生命系统高度复杂,人工设计的基因线路需要海量工程化的试错和优化。
基于工程设计原则,利用工程可预测性控制复杂系统构建的”设计-构建-测试-学习”循环(DBTL)逐渐成为合成生物学的核心策略。
AI技术的突飞猛进,就像闪进DBTL循环中的“新能源”。拥有海量数据的持续学习能力和在未知空间的智能探索能力,可以进行高效的基因注释、蛋白质功能预测、基因线路预测、代谢网络预测、复杂微生物群落表征等等,极大加快了DBTL循环效率。
虽然人工智能与合成生物学的交叉融合仍处于发轫之始,但已有来自学术界、产业界的各类成果涌现。
为打通合成生物DBTL循环,态创生物搭建了Tidetron Tao「本道」自动化研发平台,内载菌株库与元件库、iTidetron AI引擎、COMDEL活性肽预测和挖掘模型等,极大提升研发效率,链接研发生产每一步。
其中,iTidetron AI引擎结合人工智能、大数据、生物信息技术,搭建活性物质和菌株鉴定、可控基因表达、代谢通路设计、可控生物传感、酶设计与改造、干湿实验结合六大模块,攻克研发难题、驱动物质快速量产。
此外,态创生物自主开发的COMDEL活性肽预测和挖掘模型,具有准确性高、稳定性好和实用性广等优点,可助力实现在新型原料设计上的突破。
该模型覆盖多种活性肽预测模块,首期即将在态创生物官网上线开放AI抗菌肽预测和挖掘模型,敬请期待!